O Conselho Geral é o órgão de representação das Associações de Estudantes da UL, que se tenham associado à AAUL, e dos alunos das faculdades da Universidade de Lisboa, incumbido de definir as linhas programáticas da atividade da AAUL, e de acompanhar e apreciar a sua execução.

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​É composto pelos presidentes das AEs associadas e por 29 estudantes eleitos, conforme a percentagem de alunos que a sua instituição representa no universo da Universidade de Lisboa, sendo garantidos, pelo menos, dois por instituição. 

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