O Conselho Geral é o órgão de representação das Associações de Estudantes da UL, que se tenham associado à AAUL, e dos alunos das Faculdades da Universidade de Lisboa, incumbido de definir as linhas programáticas da actividade da AAUL, e de acompanhar e apreciar a sua execução. É composto pelos Presidentes das AE’s associadas e por 29 estudantes directamente eleitos, conforme a percentagem de alunos que a sua instituição representa no universo da Universidade de Lisboa, sendo garantidos, pelo menos, dois por cada instituição
Composição:
4 estudantes da Faculdade de Ciências + Presidente da AEFCL
4 estudantes da Faculdade de Direito + Presidente da AAFDL
4 estudantes da Faculdade de Letras
3 estudantes da Faculdade de Medicina
3 estudantes da Faculdade de Farmácia + Presidente da AEFFUL
3 estudantes da Faculdade de Belas Artes + Presidente da AEFBAUL
3 estudantes da Faculdade de Psicologia CE + Presidente da AEFPCEUL
3 estudantes da Faculdade de Medicina Dentária + Presidente da AAMDL
2 estudantes do Instituto de Ciências Sociais + Presidente da AAICS